Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clpsl2Q3UW21 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clpsl2Q3UW21 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clpsl2Q3UW21 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clpsl2Q3UW21 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clpsl2Q3UW21 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clpsl2Q3UW21 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clpsl2Q3UW21 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms