Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr1d1Q3UV55 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr1d1Q3UV55 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms