Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb2Q3UUV9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb2Q3UUV9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms