Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trat1Q3UU67 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms