Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chpf2Q3UU43 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chpf2Q3UU43 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms