Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim15Q3UTD9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim15Q3UTD9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms