Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf48Q3US17 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms