Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec31aQ3UPL0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec31aQ3UPL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms