Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNX5

Acsm3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm3Q3UNX5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsm3Q3UNX5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsm3Q3UNX5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acsm3Q3UNX5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acsm3Q3UNX5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsm3Q3UNX5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms