Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd27Q3UMR0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms