Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrch2Q3UMG5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms