Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cobll1Q3UMF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cobll1Q3UMF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cobll1Q3UMF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms