Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp3Q3ULW8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp3Q3ULW8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Parp3Q3ULW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms