Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam83fQ3UKU4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam83fQ3UKU4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms