Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3aQ3UFY4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms