Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc10a4Q3UEZ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc10a4Q3UEZ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms