Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtpbp6Q3U6U5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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