Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U595 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U595 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3U595 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U595 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U595 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U595 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U595 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U595 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U595 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U595 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U595 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U595 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U595 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U595 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U595 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U595 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U595 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U595 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms