Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssbp4Q3U4B1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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