Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms