Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms