Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc174Q3U155 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc174Q3U155 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms