Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hace1Q3U0D9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms