Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hhla1Q3TYV2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hhla1Q3TYV2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms