Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc28Q3TX51 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms