Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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