Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pnpla6Q3TRM4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms