Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XylbQ3TNA1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XylbQ3TNA1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms