Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sppl2bQ3TD49 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2bQ3TD49 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms