Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4k2aQ2TBE6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4k2aQ2TBE6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pi4k2aQ2TBE6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pi4k2aQ2TBE6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms