Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ush2AQ2QI47 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ush2AQ2QI47 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms