Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox4fQ2MDF8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox4fQ2MDF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms