Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Shroom4Q1W617 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Shroom4Q1W617 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Shroom4Q1W617 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
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