Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim71Q1PSW8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim71Q1PSW8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms