Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sap25Q1EHW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sap25Q1EHW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sap25Q1EHW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms