Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Perm1Q149B8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Perm1Q149B8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Perm1Q149B8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms