Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VgfQ0VGU4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VgfQ0VGU4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VgfQ0VGU4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms