Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc162pQ0VG85 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms