Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne7Q0VE82 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cpne7Q0VE82 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne7Q0VE82 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms