Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rundc1Q0VDN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rundc1Q0VDN7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms