Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb8Q0VBD0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb8Q0VBD0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms