Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab42Q0PD08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab42Q0PD08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab42Q0PD08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms