Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1bQ0MW30 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurl1bQ0MW30 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms