Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms