Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21bQ0HA38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc21bQ0HA38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms