Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q08AU9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q08AU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q08AU9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q08AU9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q08AU9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q08AU9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q08AU9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q08AU9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms