Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc4Q08624 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms