Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnma1Q08460 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms