Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CbfbQ08024 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms