Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F13bQ07968 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms