Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AmbpQ07456 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms